Bevattning är en av de viktigaste uppgifterna för bonsaiväxter. Bevattning verkar enkelt, men det är inte lätt att vattna rätt. Bevattning bör utföras beroende på växtart, årstidsväxlingar, tillväxtperiod, blomningsperiod, viloperiod och växtens väderförhållanden. Att behärska vattningstid och mängd är mycket viktigt för växternas tillväxt. Döden hos vissa bonsaiväxter är direkt relaterad till felaktig vattning.

Förutom att förse krukväxter med vatten och näring, upprätthåller krukjord även växternas normala luftandning. När krukjorden har tillräckligt med fukt expanderar jordpartiklarna och pressar ut luften i mellanrummen mellan partiklarna, vilket orsakar luftbrist i krukjorden. När krukjorden är torr eller relativt torr krymper jordpartiklarna, volymen blir mindre och mellanrummen mellan partiklarna uppstår igen. Mellanrummen fylls med luft.

När jorden växlar mellan torr och våt cirkulerar även luften i krukjorden kontinuerligt, vilket gör att växtrötterna kan andas normalt. Efter varje vattning kommer växtens rötter att kunna tolerera syrebristen i krukjorden inom en kort tidsperiod. Men om krukjorden är för våt under en längre tid, vilket resulterar i långvarig syrebrist, kommer det att orsaka roterosion och andra sjukdomar. Om jorden är torr under en längre tid, trots att det finns tillräckligt med syre i krukjorden, kan växterna inte absorbera vatten under en längre tid, vilket också är skadligt för växternas tillväxt och kan till och med få dem att dö. Därför bör principen "vattna dem inte när de är torra, vattna dem noggrant" följas när man vattnar bonsaiplantor.

Otillräcklig vattning och uttorkning av växter gör att kvistarna vissnar och slokar, och bladen vissnar, gulnar och faller av. Hos barrträd blir nålarna mjuka och förlorar sin starka och taggiga känsla. Vid allvarlig vattenbrist krymper grenarnas hjärnbark som gåshud. Om du stöter på denna situation på sommaren bör du omedelbart flytta växten till en skuggig plats. När temperaturen sjunker, spraya först vatten på bladen, häll sedan lite vatten i krukan och häll sedan över ordentligt med vatten efter en timme.

För svårt uttorkade växter, se till att inte vattna tillräckligt på en gång, eftersom när växten är svårt uttorkad har rotbarken krympt och ligger nära xylemet. Om en stor mängd vatten plötsligt tillförs kommer rotsystemet att expandera på grund av snabb absorption av vatten, vilket gör att barken brister och leder till att växten dör, så det krävs en gradvis anpassningsprocess. Efter att växter som har allvarlig vattenbrist har genomgått ovanstående behandling är det bäst att hålla dem i ett skuggigt skjul i några dagar och sedan odla dem i solen när de är starka. Övervattna dock inte. Förutom att få växterna att växa brant, vilket påverkar trädets form och prydnadsvärde, kan överdriven vattning också lätt orsaka rotröta och död. Miniatyrbonsai-krukor kräver mindre jord, så det är särskilt viktigt att vattna dem vid rätt tidpunkt och i rätt mängd.